상온우유와 저온살균우유는 가공기술, 영양소, 보존특성 및 맛 측면에서 각자의 특점을 갖고 있으며 단순히 어느것이 더 낫다고 말할 수 없다.
저온살균우유는 저온(섭씨 60~80도)에서 우유를 가열한 다음 급속랭각하여 만든다. 상온우유는 초고온살균법으로 우유를 섭씨 135~145도에서 순간적으로 가열하고 일정시간(보통 2~6초) 유지하여 만든다. 두가지 살균방법은 주로 류통기한과 풍미에 영향을 미친다.
우유의 가장 핵심적인 영양소는 우유단백질과 우유칼시움인데 이 점에서 저온살균우유와 상온우유 사이에는 절대적인 차이가 없다.